15世纪，德国巴伐利亚的牧师发现夏天酿造的啤酒容易变质，猜测一定与温度有关，于是将发酵后的啤酒放在凉爽的洞穴中，并在储罐周围堆满冰块。 .酵母在低温下活性较低，发酵过程减慢，一些酵母沉到容器底部，顶部的沉重垃圾消失了。在多次尝试分离沉入底部的酵母后，他们发现在低温下用底部酵母酿造啤酒使生产过程更加稳定。
Lager 在德语中的意思是“酒窖”，随着时间的推移，在较低温度下酿造的啤酒被称为啤酒。在显微镜出现之前，虽然酵母的培养和使用方式很简单，但酵母究竟是什么以及它为什么会引起发酵还不清楚。 1680 年，荷兰人列文虎克使用显微镜在啤酒中发现了微小的圆形物体。这可能是人类第一次真正看到酵母，但他不知道这些物体是生物。 1857年，法国化学家路易斯．巴斯德发现酵母是一种能够将糖分分解为酒精和二氧化碳的微生物，首次揭示了发酵是微生物而非化学过程，啤酒变质是由有害微生物引起的。巴斯德彻底改变了酿造工艺，将其转变为一门科学，一个受控的过程。
1883年，丹麦嘉士伯公司首次分离出纯酵母菌株，命名为“嘉士伯酵母”，利用纯酵母生产啤酒以保持高口感，在啤酒历史上首次解决了质量问题稳定。 1886年，荷兰公司Heineken也分离出了Heineken A酵母的优质酒精亲本菌株。今天，嘉士伯和喜力使用的酵母仍然是该菌株的后代。喜力还向世界各地的啤酒厂出售酵母。
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